1、对象不同：教师资格证认定的对象是考取了中小学教师资格考试合格证明的考生，教师资格证注册的对象是取得了教师资格证书、已经聘用为教师的人员。人们要经过教师资格认定，取得教师资格证书，才能进行教师资格证五年一注册。

2、流程不同：教师资格认定要先在网上申报，再现场受理认定，时间为每年两次。教师资格证五年一注册，初次注册时，需要被聘用的教师在试用期满考核合格之日起60日内，申请首次注册。

3、内容不同：教师资格证认定是考核考生的中小学教师资格考试是否合格、身体素质以及各种学籍、户籍、学历标准。教师资格证注册是指已对纳入注册范围的地区、学校和教师，按照省级教育行政部门和当地教育行政部门以及任教学校的文件和通知要求，按时进行定期注册。